Nghiên cứu đường lây truyền của vi khuẩn Enterococcus faecium kháng vancomycin tại Khoa Hồi sức tích cực Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới Trung ương từ dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen

Tác giả: BÙI NHẬT LỆ, LÊ THỊ HỘI, NGUYỄN VŨ TRUNG, PHÙNG THANH HƯƠNG

TÓM TẮT

Vi khuẩn Enterococcus faecium là một trong những căn nguyên hàng đầu gây nhiễm khuẩn bệnh viện (NKBV), với các bệnh lý thường gặp như viêm nội tâm mạc, viêm túi mật, nhiễm trùng vết thương hở và nhiễm khuẩn tiết niệu. Một số trường hợp có thể dẫn đến nhiễm trùng huyết, là nguyên nhân chính gây tử vong ở các bệnh nhân nhiễm E. faecium [7]. Vancomycin là một trong những kháng sinh đầu tay khi điều trị nhiễm khuẩn do E. faecium, tuy nhiên do tình trạng lạm dụng kháng sinh mà sự xuất hiện của các chủng E. faecium kháng vancomycin (VREfm) ngày càng trở nên phổ biến.

Tại Mỹ, khoảng 80% số chủng E. faecium gây nhiễm khuẩn bệnh viện là các chủng đã kháng vancomycin và gây ra gần 25 000 ca tử vong mỗi năm. Những thách thức trong việc lựa chọn kháng sinh điều trị đã khiến tỉ lệ tử vong do VREfm cao gấp 2,5 lần so với chủng nhạy thông thường [3].

Những tiến bộ trong công nghệ giải trình tự toàn bộ hệ gen (WGS) có thể giúp xác định nhanh chóng, chính xác và toàn diện đường lây truyền của các tác nhân gây bệnh trong môi trường bệnh viện và cộng đồng, từ đó giảm thiểu sự lây lan của vi khuẩn/vi rút cũng như giảm gánh nặng bệnh tật và chi phí điều trị cho bệnh nhân [6]. Ứng dụng trong điều tra và kiểm soát các đợt dịch có khả năng lây truyền cao do tác nhân vi rút, như SARS-CoV-2, hoặc vi khuẩn đa kháng như P. aeruginosa đã chứng minh vai trò của WGS khi phát hiện kịp thời nguồn lây và ngăn chặn đường lây truyền một cách hiệu quả [9]. Các nghiên cứu sử dụng dữ liệu WGS ngày càng trở nên phổ biến do bên cạnh việc cung cấp các thông tin giá trị như định danh, xác định sự có mặt của gen kháng thuốc, WGS còn giúp phân biệt các chủng VRE gây ra đợt dịch mà kỹ thuật định typ thông thường không phát hiện được, từ đó kiểm soát đường lây truyền và giảm thiểu sự lan rộng của các chủng đa kháng thuốc [1].

Tại Việt Nam, theo nghiên cứu của Trần Thị Thanh Nga và CS. (2014) ở các bệnh nhân mang vi khuẩn E. faecium tại Bệnh viện Chợ Rẫy, tỉ lệ kháng với vancomycin là 35% [10]. Tuy nhiên, Việt Nam hiện có rất ít dữ liệu WGS của VREfm cũng như chưa có nghiên cứu nào sử dụng WGS để nghiên cứu đường lây truyền. Vì vậy, chúng tôi tiến hành nghiên cứu này với mục tiêu phân tích đường lây truyền của E. faecium kháng vancomycin ở các bệnh nhân điều trị tại Khoa Hồi sức tích cực (ICU), Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới Trung ương.

4-4
Đầu trang
Tải